laVia
登革病毒全基因體分析的熱帶解方
全自動跨片段轉譯組裝、四血清型即時分型、E 蛋白變異標註、共識與差異序列計算專為登革病毒 (Dengue Virus) 打造的一站式視覺化資訊分析平台
為熱帶傳染病防治而生的功能
六大核心模組，涵蓋從序列輸入到血清型分析的完整工作流程
全基因體跨片段組裝
針對登革病毒約 11kb 單股 RNA 基因組，自動完成 C、prM、E、NS1-NS5 等基因產物跨片段轉譯與組裝。
四種血清型自動分型
依據標準病毒命名自動區分 DENV-1、DENV-2、DENV-3、DENV-4 四種血清型，並標註基因型 (genotype) 層級資訊。
E 蛋白關鍵突變偵測
聚焦於 E 蛋白 Domain I/II/III 的抗原決定位點，自動標註與抗體中和能力與宿主細胞嗜性相關的關鍵突變。
ADE 風險評估
內建抗體依賴性增強 (ADE) 預測模型，評估二次感染與不同血清型交叉反應對宿主免疫的潛在風險。
蟲媒監測整合管理
支援 FASTA、GenBank、ArboMap 等格式，並可串接 Aedes aegypti、Aedes albopictus 蚊媒監測資料。
熱帶疫情儀表板
即時呈現各血清型流行分布、地區性疫情趨勢與氣候因子相關性分析。
從原始序列 到血清型即時辨識
FlaVia 將登革病毒序列依據標準病毒命名自動完成跨片段組裝，並以視覺化平台串聯型別、地區、年份、血清型與宿主資訊，讓研究者快速洞察熱帶疫情關鍵動態。
E 蛋白二聚體， 抗原性即時掌握
即時渲染登革病毒 E 蛋白二聚體三維結構，動態標註 Domain I/II/III、融合迴圈 (fusion loop) 與宿主受體結合區域，協助評估抗體中和效能與疫苗開發。
基因型辨識， 秒判 DENV 子型
FlaVia 的 Pattern 辨識引擎結合系統發生學與機器學習，可在數秒內精準辨識 DENV-2 Asian I/II、Cosmopolitan、American 等基因型，並標註特徵性 SNP。
簡單 四步驟，即刻開始
從序列匯入到血清型報告，FlaVia 讓登革熱研究變得直覺簡單
上傳序列
支援 FASTA、GenBank、ArboMap 批次匯入
自動分型
一鍵血清型與基因型分類
視覺化呈現
互動式系統發生樹與地理分布圖
匯出報告
產生符合熱帶疾病監測規範的報告
技術規格
適用於各種登革熱研究情境的完整技術棧
輸入格式
- FASTA
- GenBank
- ArboMap CSV
- GFF3
- BED
- SAM/BAM
分析引擎
- BLAST+ 整合
- MAFFT 多序列比對
- IQ-TREE 建樹
- DENV 基因型資料庫
視覺化
- WebGL 3D 渲染
- D3.js 互動圖表
- 系統發生樹
- 地理疫情熱圖
平台支援
- Windows 10/11
- macOS 12+
- Linux (Ubuntu 20+)
- Web 版 (即將推出)